因客户投诉，是否违反法律？

公司扣1000元可能违法，需具体判断。依据《劳动法》，用人单位不得克扣工资。若公司无故扣款，将损害员工权益，影响员工生活及工作积极性，甚至引发劳动纠纷。
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公司扣钱可处理。操作：1.收集扣款证据，如工资条、扣款通知等；2.尝试与公司沟通，了解扣款原因并要求解释；3.若沟通无果，向劳动保障部门投诉或申请劳动仲裁；4.根据仲裁结果，决定是否进一步法律诉讼。
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公司扣钱可申诉或仲裁。建议先与公司沟通解决，若无果，则向劳动保障管理部门申诉或向劳动仲裁委员会申请仲裁，根据扣款原因和证据选择合适方式。